科研小萌新，掌握这些技巧，轻松玩转各个基因！
本文转载自“科研小助手（微信号：SciRes）”
科研的基本研究便是基因的研究，拿到一个新基因，第一步要做的便是查阅文献、数据库，用一切方法来确定基因是否值得研究。下面我就介绍几个常用网站，以模式动物小鼠基因MMP2为例，对基因进行初步分析。
一：基因基本信息
1.首先通过biogps网站(http://biogps.org/#goto=welcome)看一下基因的组织表达。
(1)输入基因名称，选择物种，这样就可以看到该基因在各个组织的表达分布情况。
(2)改变右上角的change database,还可以查看不同数据库该基因的组织表达情况。
2、文献的海洋一望无际，简直无从下手，如果基因有一张ID卡就好了。此时就可以通过小鼠基因数据库 MGI (http://www.informatics.jax.org/)对基因进行简单了解。
（1）数据库对小鼠基因名称全称以及别名，基因的染色体定位均有详细介绍，一目了然。
(2)数据库介绍了基因的 GO数据库信息，包含1）分子功能。2）细胞学组件。3）生物学途径等。同时也可查看基因分子功能、突变以及表型分析、蛋白信息。
3.基因功能研究最终为人类基因研究。小鼠基因与人类基因同源性比较是不可缺少的一部分。进入Pubmed主页，点开“BLAST”,选择“Nucleotide”，点击“Align two or more sequence”,分别输入人类基因与小鼠基因ID。点击“blast”,就可以得到基因的相似性。
4.当然，也可以进入人类基因数据库genecards (http://www.genecards.org/)，这个数据库包含的内容有基因表达，相关抗体信息，可能参与通路，同源性分析等等。
二、 基因研究可行性。
1. 基因研究，最重要的是功能域的研究。UniProt（ http://www.uniprot.org/）是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库，可以查询到大量来自文献的蛋白质生物功能信息。注：科研小助手在之前的推文中有对UniProt做过详细的介绍，参见：『这个数据库送给你，一站式查询蛋白分子量、功能、结构域和经典转录本等信息！』
2. 对于基因已知功能与是否具有研究可行性，首先要了解基因蛋白功能域。Interpro （https://en.wikipedia.org/wiki/InterPro）是常用蛋白组学分析网站。输入基因名称，可以搜索到蛋白质三维结构，以及相关功能域。
3.最后，通过以上网站对基因有了初步了解，就需要查阅文献仔细阅读，认真分析，对基因功能获得详细了解，最常用的便是pubmed、web of science等。这可不能偷懒哦。生信宝典介绍的文献挖掘查找指定基因调控网络也是很好的工具。
更多数据库学习见：