维恩(Venn)图绘制工具大全 （在线+R包）

Online tools

• 2-30 Venn Diagrams (non-proportional)

  http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/

• 2-6 Venn Diagrams (non-proportional)

  http://bioinfo.genotoul.fr/jvenn/example.html

  
  

• 2-4 Venn (non-proportional)

  http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

• 2-3 Venn (non-proportional)   

  http://genevenn.sourceforge.net/

• 3-way Venn (proportional) 

  http://www.cmbi.ru.nl/cdd/biovenn/index.php

• 3-way Venn (proportional)

  http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn.cgi

• 4-way Venn (proportional)

  http://www.pangloss.com/seidel/Protocols/venn4.cgi

  
  

Local tools

• 2-8 Venn Diagrams (proportional, nested, powerful)

  https://github.com/linguoliang/VennPainter

  
  

• 2-6 Venn Diagrams (proportional)                       

  http://sysbio.uni-ulm.de/?Software:VennMaster

  
  

• 3-way Venn diagram (proportional)

  http://omics.pnl.gov/software/venn-diagram-plotter

R packages

• VennDiagram (non-proportional)

  R语言学习 - 韦恩图

  One easy way of using VennDiagram https://github.com/Tong-Chen/s-plot

• venneuler (proportional, may not always right)

Other intersection solutions

• UpSetR: http://www.caleydo.org/tools/upset/

• Bubble PLot: http://bl.ocks.org/mbostock/4063269

• ChordDiagram: http://bl.ocks.org/mbostock/4062006

ImageGP 

R统计和作图

• Graphpad，经典绘图工具初学初探

• 在R中赞扬下努力工作的你，奖励一份CheatShet

• 别人的电子书，你的电子书，都在bookdown

• R语言 - 入门环境Rstudio

• R语言 - 热图绘制 (heatmap)

• R语言 - 基础概念和矩阵操作

• R语言 - 热图简化

• R语言 - 热图美化

• R语言 - 线图绘制

• R语言 - 线图一步法

• R语言 - 箱线图（小提琴图、抖动图、区域散点图）

• R语言 - 箱线图一步法

• R语言 - 火山图

• R语言 - 富集分析泡泡图

• R语言 - 散点图绘制

• R语言 - 韦恩图

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• 1 数据类型（向量、数组、矩阵、 列表和数据框）

• 2 读写数据所需的主要函数、与外部环境交互

• 3 数据筛选——提取对象的子集

• 4 向量、矩阵的数学运算

• 5 控制结构

• 6 函数及作用域

• 7 认识循环函数lapply和sapply

• 8 分解数据框split和查看对象str

• 9 模拟—随机数、抽样、线性模型

• 1 初识ggplot2绘制几何对象

• 2 图层的使用—基础、加标签、注释

• 3 工具箱—误差线、加权数、展示数据分布

• 4 语法基础

• 5 通过图层构建图像

• 6 标度、轴和图例

• 7 定位-分面和坐标系

• 8 主题设置、存储导出

• 9 绘图需要的数据整理技术

• 创建属于自己的调色板

• 28个实用绘图包，总有几个适合你

• 热图绘制

• R做线性回归

• 绘图相关系数矩阵corrplot

• 相关矩阵可视化ggcorrplot

• 绘制交互式图形recharts

• 交互式可视化CanvasXpress

• 聚类分析factoextra

• LDA分析、作图及添加置信-ggord

• 解决散点图样品标签重叠ggrepel

• 添加P值或显著性标记ggpubr

• Alpha多样性稀释曲线rarefraction curve

• 堆叠柱状图各成分连线画法：突出组间变化

• 冲击图展示组间时间序列变化ggalluvial

• 桑基图riverplot

• 微生物环境因子分析ggvegan

• 五彩进化树与热图更配ggtree

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