从竞争对手到合作共赢——预印本助力elife新文解密昆虫气味受体起源

两个多月前，我们在五月预印本好文速览中向大家推送了关于昆虫受体（odorant receptor;简称OR）起源的文章。就在上个月，该文已被著名高水平开放获取（open access）学术期刊elife 接受并在线刊发。

由于之前已做过介绍，这里不多费笔墨。简言之，由于在嗅觉产生中扮演的重要角色，气味受体（OR）是昆虫及许多动物中的一个极为重要蛋白。2014 发表在elife上的一篇文章发现OR只存在于有翅类昆虫中，而在属于更早分化的分支（basal lineages）无翅类昆虫石蛃目（Archaeognatha）中未发现，进而认为昆虫OR是其对飞行生活的适应进化来的(Missbach et al., 2014)。本文的作者们驳斥了该观点：他们通过对新的无翅类昆虫衣鱼的基因组测序，以及更为系统的系统进化学（phylogenetics）分析，发现在昆虫进化出飞行能力之前的无翅昆虫中已经有OR存在，而在basal lineages中生活在潮湿环境中的物种不存在（下图：弹尾目Collembola，双尾目：Diplura等），并提出OR是昆虫对于其陆生生活而非飞行的适应。

来自原文Fig. 1 (Brand et al., 2018)

与本文所讲述的故事相比，更为有趣的或许是其背后的故事。实际上，小编当时在bioRxiv中对相关文章进行搜索时，意外地发现了两篇几乎是相同主题的预印本（preprint），除这篇刚刚发表于elife的文章之外，还包括一篇今年年初的预印本文章，该文只有一位作者：来自伊利诺伊大学香槟分校（UIUC）的Hugh Robertson教授(Robertson, 2018)。原来，来自加州大学戴维斯分校（University of California Davis）的Brian R. Johnson实验团队一直在进行对于衣鱼的基因组测序工作，并探索其基因组中是否存在编码OR的基因。功夫不负有心人，其团队在今年年初得到了令人振奋的结果：在无翅昆虫中发现了OR基因，一举推翻了此前(Missbach et al., 2014)的观点。而就在一周之后，他们惊奇地在bioRxiv上发现了来自UIUC的Robertson的独立作者的文稿，其中给出了相似的结论(Robertson, 2018)。所不同的是，加州戴维斯团队是通过基因组测序，而UIUC的Robertson则是基于公共数据库的资源进行系统进化分析(Robertson, 2018)。于是，来自加州大学戴维斯分校的博士生Philipp Brand提议，与其展开竞争，不如两个实验室联合起来搞一个影响力更大的文章（Garvey, 2018）。双方一拍即合。于是，在大家的共同努力下，他们最终合作写了一篇手稿，而UIUC的Robertson教授也和Philipp Brand一道作为文章的并列一作（Brand位列第一）。虽然他们反驳的文章也刊发在elife上(Missbach et al., 2014)，但作者们并未有意避开，二是反其道而行之将文章投往相同的杂志，并同时在bioRxiv以预印本的形式投放。经过两个多月的审稿之后，本文终被接受，也达成了开放科学和预印本助力论文发表的一段佳话。

引文

Brand, P., Robertson, H.M., Lin, W., Pothula, R., Klingeman, W.E., Jurat-Fuentes, J.L., and Johnson, B.R. (2018). The origin of the odorant receptor gene family in insects. elife 7.

Missbach, C., Dweck, H.K., Vogel, H., Vilcinskas, A., Stensmyr, M.C., Hansson, B.S., and Grosse-Wilde, E. (2014). Evolution of insect olfactory receptors. elife 3:e02115.

Robertson, H.M. (2018). On the origin of the odorant receptor gene family in insects: evidence from the dragonfly Ladona fulva and the mayfly Ephemera danica. bioRxiv.

Garvey K.K., (2018) Groundbreaking Research: Odorant Receptor Genes Found in Wingless Insect, http://ucanr.edu/blogs/blogcore/postdetail.cfm?postnum=27825

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